GENOM 2005
"Affymetrix" matricų mikroschemų analizė
Turtinga ir patogi programa, skirta analizuoti matricų eksperimentus (pvz., Affymetrix tiekėjo Affymetrix). Joje pateikiama papildoma informacija apie genus, daugybė analizės metodų, automatinis kelių žemėlapių sudarymas su redaktoriumi, funkcijų prognozavimas...
Mikroskysčių DNR analizė
"Genom 2005" kiekvieno signalo duomenys pateikiami skirtingomis spalvomis. Galite greitai apžvelgti duomenis. Kiekvienoje eilutėje pateikiamas kiekvieno zondų rinkinio geno pavadinimas ir prisijungimo numeris.
Genų raiškos grafikas
Tai schema su vienu masyvu. Joje rodomas kiekvieno zondų rinkinio stulpelis.
3D vaizdas
Kiekvieną matricos signalą galite rodyti 3D rodinyje. Lygindami jį su kitu masyvu, galite lengvai rasti įdomius zondų rinkinius. Signalus taip pat galite rūšiuoti pagal genų funkcijas arba genų vietą.
Chromosomos vieta
Šiame rodinyje rodomi visi zondų rinkiniai pagal jų vietą chromosomoje.
Genų raiškos procesas
Šioje ekrano nuotraukoje pavaizduota diagrama, kurioje kiekvienas zondų rinkinys pavaizduotas linija. Jis rodo geno reguliavimą aukštyn/žemyn skirtingais laikotarpiais.
Kelio vaizdas
Šioje ekrano nuotraukoje parodytas įkeltas kelias, kuris tiesiogiai sujungtas su įkeltais masyvo duomenimis.
Kelio redaktorius
Naudodamiesi šiuo integruotu žemėlapių redaktoriumi galite lengvai kurti naujus kelius arba redaguoti esamus.
Geno funkcijos numatymas
Dažnai apie zondų rinkinį neturite jokios informacijos, nes jis yra EST arba anksčiau nebuvo analizuotas. Naudodamiesi šiuo moduliu galite gauti naujos informacijos apie zondų rinkinius arba pasirinktines sekas per BLAST paiešką (internete). Tada bus parodytos galimos naujos genų funkcijos.
Išsami informacija apie funkcijų prognozavimą
Išsami informacija apie funkcijos prognozę.
PubMED tyrimai
PubMED yra didžiausia pasaulyje medicinos straipsnių duomenų bazė (talpinama Ncbi svetainėje). Šis modulis atlieka paiešką toje duomenų bazėje ir grąžina atitinkamus rezultatus pagal įvestą terminą (arba geną).
MeSH tyrimai
MeSH (angl. Medical Subject Headings) pateikia tvarkingus terminus, kurie pagerina "PubMED" paiešką, pvz.
Genų tinklas
"PubMED" santraukose aprašytų genų ryšiai čia pateikiami kaip ryšių diagrama.
Mikroschemų genų funkcijos
Šis algoritmas pateikia duomenis lentelėje su visomis genų funkcijomis iš anksčiau filtruotų genų arba gali būti taikomas visai matricai.
"GeneOntology" masyvui
Tai rodo genų funkcijas į "GeneOntology" panašiame rodinyje.
Zondų rinkinio informacija
Genų informacijos dialogo langas. Čia pateikiama išsamesnė informacija apie ieškomą užklausą, pvz., seka, aprašymas ir kita.
Išsami informacija apie zondų rinkinį
Šioje ekrano nuotraukoje galite tiesiogiai pasiekti nuorodas, kad gautumėte daugiau informacijos apie užklausą. Kitaip nei kitose programose, galite spustelėti nuorodą ir tiesiogiai pasiekti rezultatų puslapį, nepildant žiniatinklio formų.
"Probeset" funkcijos
Kita "GeneOntology" geno funkcijų diagrama iš geno.
Interneto tyrimai
Šioje ekrano nuotraukoje matote tiesiogines nuorodas, kuriomis galite gauti daugiau informacijos apie užklausą. Kitaip nei kitose programose, galite spustelėti nuorodą ir patekti tiesiai į rezultatų puslapį, nepildant žiniatinklio formų.
Klasterio vaizdas
Šį klasterį galima lengvai pagaminti. Jame pavaizduotos labiausiai vienodos vertės, suporuotos į grafiką.
Sklaidos grafikas
Kitas klasterio algoritmo vaizdas.
